محمد شریف، وکیل دکتر ملکى در باره پرونده او گفته است: «طبق کیفرخواست صادره موکلم به اتهام ارتباط با یکى از سازمانهاى غیرقانونى و به استناد ماده ۱۸۶ قانون مجازات اسلامى به محاربه متهم شده است». آقای شریف همچنین گفت موکلش به اتهام های دیگری مثل «توهین به آیت الله خمینی و آیت الله خامنه ای و نیز تبلیغ علیه نظام» متهم است